蔡英文雖高票當選黨主席，但立法院接下來將展開朝野攻防，包括《兩岸監督條例草案》、《自由經濟示範區草案》、《公職人員選罷法修正案》都排入院會，未來蔡英文如何運用社會動能，修補黨內關係，並在立院攻防中與國民黨交手，這都是蔡英文急需面對的課題。
【小英困境重重】學者也認為，未來民進黨的大陸政策、兩岸論述、年底選舉以及與公民團體的競合關係等，都考驗著蔡英文的智慧。
資深媒體人胡幼偉在臉書上指出，蔡此次雖順利當選黨主席，她其實將眼光放在2016的總統大選。但經過3月學運後學生代表林飛帆、陳為廷幾乎「把整個民進黨都當屬下使喚，蔡的政治光環被搶去大半」。如果蔡搬出傳統的綠營做法，恐怕會把中間選民嚇跑；再加上民進黨內部各有主見，這對蔡英文未來若要參選總統恐怕是一大困境。
「民進黨從318學運過後就被邊緣化，對國內重大議題都沒有提出具體看法。」台大經濟系教授、新台灣國策智庫顧問林向愷受訪時感嘆說，他對於誰當選黨主席都沒有意見，但近年來民進黨對很多國內議題，都沒有提出看法，只是以民調決定黨的方向，在主導議題上明顯有被邊緣化的趨勢。
【學者：先提具體方向】林向愷說，身為反對黨，民進黨應該要走在社會的前面主導議題，但2008年後民進黨一心只想奪回政權。他指出，國民黨對經濟議題有明確的國際化、自由化的方向，反觀民進黨對經濟議題並沒有提出明確作法，「一個黨不可能在沒有意見之下就能討好多數選民。」他建議，蔡英文應該要儘快提出經濟、社會改革的方向與政策。
前立委林濁水表示，未來兩岸政策不會有太大差異，民進黨去年曾透過中國事務委員會與華山會議的討論，將立場、價值重新做確認。未來民進黨要處理的是政策，尤其是在318學運過後提出對兩岸主權與經濟分配上的諸多問題。
「在兩岸協議監督條例中，國民黨不可能接受隱含有『兩國論』，或『一邊一國』的條文，但蔡英文曾擔任過陸委會主委，還是兩岸問題的專家，她應有能力處理這個問題。」林濁水說，蘇、蔡兩人在對中的戰略、價值的立場上已經有共識，也認為逢中必反的觀念必須要調整，目前只有具體政策與執行面的問題。
台灣智庫副執行長賴怡忠對新任黨主席提出建議說，此次學運過後就可以看出，民進黨在反對民眾的力量上已經失去領導能量，這是蔡英文必須要特別去處理的一點。另外民進黨過去把太多力量利用在政黨協商上，本來被視為民進黨的武器，卻因其秘密作業的形式讓效力受到質疑，也讓一些不合理的法案莫名其妙被通過。蔡必須帶領民進黨必須回到初衷，與社會對話，就法案花更多時間向選民說明。